纵观我国新疆地区，农产品冷链物流对仓储运输资源缺乏系统的整合。能够在全时限内通过冷链运输的农产品比例低于40%。新疆农产品冷链运输主要应用公路和铁路运输，受中国铁路资源等要素制约，铁路冷库运输与公路冷库运输难以共同发展，影响了农产品冷藏运输效率。根据调查显示，新疆90%左右的新鲜蔬果、肉类和水产品都是在没有冷链保证的情况下用普通的货车运输的，农产品的损失较严重，仅满足了市场30%的需求量。

2018年中国冷藏能力为1.3亿立方米。但每个人平均下来所占库容量仅有0.156平方米。新疆大量正在使用的冷藏库，时间较长，设备老化、仓库多数为中型建筑库存容量有限、吞吐能力低，对于农产品的保鲜贮藏能力严重不足。在新疆189个农产品批发市场中新型的保鲜冷库不足20%，其中建立了配套冷库的只有68个。新疆水果在2018年收获1605万吨，园林1059万吨，但果品贮藏保鲜只占10%-15%，用于长期贮存的仅占3%-4%，薄弱的物流基础设施限制了冷链物流的进展。